Policlinica Stomatologică a fost fondată prin ordinul Ministerului Sănătăţii nr. 234 din 12 octombrie 1966 – despre instituirea în oraşul Chişinău a Policlinicii Stomatologice Republicane de prima categorie în baza secţiei de stomatologie a Spitalului Clinic Republican -ca una din cele mai prestigioase instituții de profil cu funcție de diriguitor al activității stomatologice la scară republicană. Au fost transferate 54 funcţiuni titulare, personal medical şi auxiliar, s-au acordat suplimentar surse financiare pentru încă 96 funcţii bugetare.
Instituţia medico-sanitară publică, Policlinica Stomatologică Republicană reprezintă o entitate înregistrată în baza Ordinului Ministerului Sănătății nr.329 din 25.11.2003, în baza Policlinicii Stomatologice Republicane și este succesoare a policlinicii menționate.
IMSP Policlinica Stomatologică Republicană este o instituţie de conducere metodică, organizare şi consolidare a serviciului stomatologic în Republica Moldova. Totodată, servește drept baza clinică a facultăţii de Stomatologie, a Universităţii de Stat de Medicină şi Farmacie „Nicolae Testemiţanu”- catedra de Chirurgie oro-maxilo-facială și implantologie orală „Arsenie Guțan”, a Facultăţii de Formare Continuă a medicilor universităţii menţionate, a Colegiului Naţional de Medicină şi Colegiului de Medicină din Balţi-contribuind la formarea asistenților medicali și a tehnicienilor dentari, inclusiv formarea continuă a acestora.
Totodată, IMSP Policlinica Stomatologică Republicană este unica entitate de profil din țară care prestează servicii de tratament stomatologic cu aplicarea anesteziei generale persoanelor cu stare psiho-emoțională precară.
Fondator instituției este Ministerul Sănătăţii Republicii Moldova şi îşi exercită drepturile prin intermediul Consiliului de Administrație si a directorului al instituției.